当院の創建は寛永十三年（1636）、三代将軍徳川家光公が、その乳母・春日局の発願により、 大和国小池坊（長谷寺）より栄誉を招いて開山とし、神田白壁町に堂宇を建立、 薬師瑠璃光如来像を本尊として「金剛寶山延壽寺根生院」と称したのが、その歴史の始まりです。
寺の名は、家光公自らが定めたと伝えられています。徳川家にゆかりの深い寺院として 朱塗りの門（赤門）を許された数少ない寺の一つでもあります。
略縁起
| 年 | できごと |
|---|---|
| 寛永十三年 （1636） | 三代将軍徳川家光公が乳母・春日局の発願により、大和国小池坊（長谷寺）より栄誉を招いて開山とし、神田白壁町に堂宇を建立。薬師瑠璃光如来を本尊とし「金剛寶山延壽寺根生院」と称す |
| 正保二年 （1645） | 第二世栄専の時、下谷二長町に移り、江戸城西の丸祈願所として寺領二百五十石を賜る |
| 貞享四年 （1687） | 七月、新義真言宗 江戸四ヶ寺の一に列す。八月、仁和寺御堂光明院の院室を兼務して院家となり、歴代の住職は幕府の命によって選ばれる寺となる |
| 元禄元年 （1688） | 本郷湯島切通し（現・文京区）の知足院跡へ移転 |
| 元禄三年 （1690） | 八月、幕府の命により江戸城にて観音経を講じ、将軍綱吉公より寺領百石を加増される |
| 元禄十六年 （1703） | 十一月、火災により類焼 |
| 享保五年 （1720） | 再建 |
| 明治初年 | 政治機構の一変により廃寺となる |
| 明治二十二年 （1889） | 下谷池之端七軒町にて、第四十四世明盛により再興 |
| 明治三十六年 （1903） | 市区改正の都市計画により、現在地（豊島区高田）へ移転。昭和十年代までは真言宗豊山派の加行道場であった |
| 昭和八年 （1933） | 「ちとせ橋」開削工事の土により、境内の池が埋められる |
| 昭和二十年 （1945） | 付近一帯の戦火の犠牲となり、山門を除いて焼失 |
| 昭和二十八年 （1953） | 境内地の一部に本堂を再建 |
| 平成十四年 （2002） | 現在の堂宇に改築 |
寺號之由来
境内に掲げられた「寺號之由来」には、家光公が「根生院」の名を定めた由来が記されています。 「根とは根本なり、生とは生物なり」——樹木の根本のように、あらゆるものを生かし支えるものであれ、という意でしょうか。
写真：寺號之由来の板
原文（漢文）が読める解像度で撮影し、現代語訳を添えて掲載します。
この地の記憶
現在地は、もと尾張候の下屋敷であったものが田安家に譲り渡され、文政の頃は一つ橋屋敷となったと伝えられています。 下屋敷の跡であり、池あり丘あり樹木あり、また清泉湧き出た幽境の地でした。
宿坂より山門までの参道は欅の並木があり、山門の奥には満々たる水を湛えた池があり、
四季折々を楽しませた。殊に菖蒲の頃は散策と参詣の人で賑わったと伝えられている。
— 根生院略縁起（寺蔵資料）
その池は昭和八年、「ちとせ橋」開削工事の土によって埋められました。 そして昭和二十年、付近一帯の戦火により、山門を除くすべてを失いました。 戦後は都市化が進み、旧本堂跡は住宅地となっています。
江戸名所図会に見る根生院
湯島切通しにあった時代の根生院は、『江戸名所図会』に描かれています。 大きな伽藍と参詣の人々の姿を、いまも版本のなかに見ることができます。
同じころの江戸切絵図にも、湯島天神の裏手に当院の寺地が記されています。
